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Salgueiros—Campeonato de Portugal - Série B—1911Samora Correia—Campeonato de Portugal - Série C—1975Samouquense——Sampedrense——Sanjoanense—Liga Portugal 3—1924Santa Clara—Primeira Liga de Portugal—1927Santa Clara B—Campeonato de Futebol dos Açores—1927Santa Cruz Alvarenga—Inactive—1977Santa Eulália Vizela——Santa Maria—AF Braga - Pró-Nacional—1943Santa Marta—AF Vila Real - Divisão de Honra—2015Santa Marta de Penaguião——Santacruzense—AF Madeira - 1ª Divisão—1935Santana——Seixal—AF Setúbal - 2ª Divisão—1925Sendim—AF Bragança - Divisão de Honra—1977Serpa—Campeonato de Portugal - Série D—1945Sertanense—Campeonato de Portugal - Série C—1934Serzedelo—AF Braga - Divisão de Honra—1967Sesimbra—AF Santarém - 1ª Divisão—1947Silves—AF Algarve - 1ª Divisão—1919Sintra—Dissolved in 2020—2007Sintrense—Campeonato de Portugal - Série D—1911Sobrado—AF Porto - Divisão de Elite—1969Social Lamas——Sourense—AF Coimbra - Divisão de Elite—1947Sousense—AF Porto - Liga Pro—1937Sport Recife——Sporting Braga B—Liga Portugal 3—1999Sporting Braga Juniores——